我们服用抗生素越多，对抗生素的抗药性就越大。这意味着，如果我们继续服用抗生素的任何和所有，即使它们没有必要，他们将停止工作，以治愈我们早，而不是晚。事实上，世界卫生组织（WHO）表示："抗生素耐药性是当今全球健康、粮食安全和发展面临的最大威胁之一。"

抗生素还有另外一个问题：它们会搅乱你的微生物群。2016年的一份报告这样总结道："除了耐药性的发展外，抗生素的使用严重扰乱了人类微生物群的生态。当抗生素干扰你的肠道时，你身体的一些关键过程会失控，包括你的身体产生维生素的能力。

但这仍然是一个相对较新的发现：多年来，医生们不明白抗生素会夺走你肠道内健康的微生物群。德拉图尔博士说："这是目前益生菌痴迷的很大一部分，因为100年前，我们还不知道结肠中的实际病菌对你的健康有任何影响。"我们一直在推行洗手液、抗生素，现在（我们）知道它们正在消灭对你有益的东西。"

但这仍是一个相对较新的发现：多年来，医生并不明白抗生素会剥夺你的肠道健康的微生物群。甚至在100年前，我们不知道你的结肠上的实际虫子对你的健康有任何影响。我们一直在推销和抗生素，现在我们知道这些正在消灭一些对你有好处的东西。

这在一定程度上解释了为什么医生和患者一直渴望益生菌，他们声称能够恢复你的微生物群到抗生素造成损失之前。一旦科学家发现抗生素不是没有问题的，医生就明白需要一种可以恢复微生物群的药片，益生菌热潮诞生了。不是所有的益生菌都被评价为药用的，不是所有的都是相同的

根据2018年《临床胃肠病学和肝病学》的一份报告，除非公司声称他们的益生菌可以治愈特定疾病，否则他们的药片在美国被。报告称："监管的重点是任何主张的合法性，而不是有效性、安全性和质量。这意味着益生菌不一定能根据它们能做些什么来恢复你的微生物群来评估（这就是为什么人们首先服用它们的原因）。